Приказом по Пензенскому Городскому отделу здравоохранения № 39 от

23 февраля 1952 года открыта «Городская больница №3» на 50 коек в двухэтажном здании, в котором до этого функционировала поликлиника №2.

Главным врачом больницы назначен Исаак Маркович Аншелес.

В 50-е годы поликлиника обслуживала 65 тысяч человек. Был развернут стационар на 100 коек, в том числе терапевтических — 40, хирургических — 30, гинекологических — 15, ушных — 5, глазных — 5, неврологических — 5.

Из транспорта: 1 легковая машина и 1 хозяйственная лошадь. Отопление печное. И несмотря на это больница уже действовала. Активно велась работа общества «Красного креста», подготовка значкистов ГСО, санпостов.

В 1960 году в возрасте 76 лет ушел из жизни Исаак Маркович Аншелес. Недолгое время главным врачом была Анна Афанасьевна Леонова, а с 1961 года главным врачом больницы назначена Надежда Николаевна Острейко.

Началась реконструкция здания больницы, после чего в 1964 году открылось 3 отделения стационара: два терапевтических, возглавляемых сначала Соколовой В.П., затем Татьяной Изосимовной Алексеевой и Эмилией Ивановой Максимовой и офтальмологическое, заведующим этого отделения был назначен Борис Михайлович Синицын, заслуженный врач РСФСР, участник Великой Отечественной войны.

В 70-х годах главными врачами больницы работали Анатолий Петрович Самохвалов и Николай Иванович Гончаренко.

В 1982 году в больницу пришел Владимир Игоревич Шелудько и руководил больницей в течение 15 лет.

На базе больницы открывается кафедра глазных болезней Пензенского института усовершенствования врачей, возглавляемая профессором Николаем Ивановичем Панфиловым, а с 1992 года кафедру возглавил молодой профессор Михаил Иванович Алешаев.

В 1986 году при непосредственном участии АО НППО «Эра» Н.К.Шихалеева началось строительство поликлиники по улице Набережная реки Мойки. В 1987 году поликлиника приняла первых пациентов.

В 1992 году произошло объединение городской больницы №3 с областной больницей № 4, первые упоминания о которой в Пензенском Государственном архиве относятся к 1938 году. Главными врачами больницы работали: Владимир Петрович Леплейский, Юрий Павлович Филин, Валентин Николаевич Евстигнеев, Александр Потапович Вохмянин.

С 1997 года по 2001 год больницу возглавляла Наталья Васильевна Гришаева, а с октября 2001 по 2005 год — Наталия Васильевна Сопина, с 2005 г. по 2007 г. — Эдуард Владимирович Маркелов, с 2008 г. по настоящее время коллектив больницы возглавляет Владимир Валентинович Марков.

Приказом     Управления     здравоохранения     в    апреле     2005 года офтальмологическая служба выделяется в самостоятельное лечебное учреждение.

Городская больница №3 — это старейшее лечебно-профилактическое учреждение, оказывающее лечебно-диагностическую, профилактическую, консультативную помощь жителям города и области. В современно оснащенных кабинетах ведут прием врачи более чем двадцати специальностей.

В 2012 году в состав больницы была введена путем присоединения «Городская больница №2», которая существовала как самостоятельное учреждение с 60-х годов XX столетия. Большой вклад в развитие Городской больницы №2 внес заслуженный врач РСФСР Гриднев В.Б., который возглавлял больницу более 20 лет.

С 01.10.2014г. все функции, выполняемые структурными подразделениями, осуществляющими первичную медико-санитарную помощь, государственных бюджетных учреждений здравоохранения «Городская больница №1» и «Пензенская городская клиническая больница №5», переданы в ГБУЗ «Городская больница №3».

На основании приказа Министерства здравоохранения Пензенской области от 21.12.2015г. №492 «О внесении изменений в приказ министерства здравоохранения и социального развития Пензенской области от 26.12.2011г №569» с 01.01.2016г наименование учреждения изменено на «Государственное бюджетное учреждение здравоохранения «Городская поликлиника».

С 01.01.2017г. все функции, выполняемые структурными подразделениями, осуществляющими первичную медико-санитарную помощь, государственных бюджетных учреждений здравоохранения ГБУЗ «Клиническая больница №4» и ГБУЗ «Клиническая больница №6 имени Г.А. Захарьина», переданы в ГБУЗ «Городская поликлиника»